.json ファイルが QMK Configurator で作ったものの場合、おめでとうございます。バグに遭遇しました。 qmk_configurator で報告してください。
そうでない場合は、... 他の .json ファイルを使用しないようにという、上に書いた注意書きを見逃してませんか?
もしスペースバーが3つに分かれている場合は、全てスペースバーで埋めるのが最善の方法です。バックスペースや Shift キーについても同じことができます。
以下を見てください。
キーマップの他のレイヤーを再確認して、おかしなキーが存在しないことを確認してください。
私たちは利用者の依頼やバグレポートを常に受け入れています。qmk_configurator で報告してください。